Лично мне, как человеку работающему в разработке, думается, что обновление у тойоты включает в себя сразу все необходимые файлы, ибо с какой версии решит обновиться человек на текущую - неизвестно заранее никому. А результат в любом варианте должен работать.
Так что чистка всех файлов перед записью новых кажется мне вполне разумной, ибо убирает возможно уже ненужные данные с диска.
