Сейчас точно не определить, что послужило причиной. Возможно, какой-нибудь не до конца воткнутый разъём, впоследствии выпавший от вибраций, или окислившиеся контакты, или глюк в блоке интегрированных реле под капотом - масса вариантов, которые диагностам следовало поэтапно проверить в соответствии со стандартной процедурой поиска неисправностей. Самым бесполезным действием было то, что в первую очередь полезли к блоку идентификации ключей. Он тут явно не причём.
ЗЫ
Заключение об отсутствии
части кода ключа это вообще нечто