Клемму с АКБ снимать собрались?
Ну надо будет обучить стеклоподъемники наверное.
Возможно еще дроссельную заслонку.
Если просто отсоедините все провода от ГУ и потом так же воткнете обратно, то ничего инициализировать не надо. Просто дать загрузиться ГУ и произвести настройки в нем как удобно.