Странная какая-то ситуация. Акронису должно быть по фигу до форматирования.
А в hdat2 сейчас у диска какой статус?
Не видя, советовать сложно, но я бы попробовал образ Акронисом восстановить, только галочку про посекторное восстановление не забудь поставить.
Кроме этого, можно установить кол-во секторов User area равным Native area, чтобы Hidden area была равна 0. У меня на диске так.
Возможно, восстановление образа исправит эту бадягу с Hidden area, а возможно, что Акронис начнёт ругаться, что мол недостаточно места. Тогда точно надо в hdat2 кол-во секторов User area править.