последние пару лет всегда копирую с заменой
ибо лениво уже делать остальное 
кроме сбрасывания части личных настроек в интерфейсе проблем не было
если есть глобальный косяк - это или криво скачанные файлы или что-то было скопировано не туда
Последние пару лет глобально ни чего не меняется в структуре файлов, по этому и нет косяков.
Но как-то было, что не много поменяли состав и структуру файлов первого раздела, косяки были поголовно.
И кстати.
Если полностью удалять файлы, а потом записывать новые, а не копировать с заменой, процедура проходит быстрее, винда меньше думает
