Да, конечно безграмотность открывает воистину необозримые просторы для домыслов 
. Дело в том, размеры FAT фиксированы и зависят не от "запутывания" чего-либо, а только от размера дискового пространства. Размер должен быть таковым, что-бы хватило места для полного списка кластеров - файл занимает столько-то кластеров, значит в области FAT будет занято место под список адресов этих кластеров, а уж какие это адреса, на размер списка никак не влияет по определению.
Вы вообще-то описали FAT на диске, а я говорил про оперативку, в которой вся таблица обычно не хранится, а подгружается по мере необходимости.
