Это изначально, одна папка там до самого корня нужно заходить, вообщем так сделаны диски, ну пофайлово обновляться и проблем не будет вообщем
Пофайлово можно и с оригинальных образов. Суть сборки в том, чтобы было удобнее обновлять целыми каталогами.
Позже проверю, допилю и перезалью.
P.S.
Когда себе обновлял, своей же сборкой - вроде папку SD целиком кидал, как она есть. А может, ошибаюсь...