Дык, принцип тот же.
При перетаскивании из окна в окно прога спрашивает - заменить папки и вложенные в них файлы? Я жму ОК.
Как вариант .
При замене могут оставаться старые файлы , которые есть в старой версии , а для новой не нужны , из за этого и не работает ....